Ο Επίκουρος Καθηγητής Μόσχος Γκουτζιούδης έχει δημοσιεύσει επιστημονικές μελέτες, άρθρα, βιβλιοκρισίες και μεταφράσεις θεολογικών έργων. Πέρα από τις μονογραφίες, άρθρα του έχουν δημοσιευτεί σε επιστημονικά περιοδικά, συλλογικούς και αφιερωματικούς τόμους, πρακτικά συνεδρίων και στο δημοσιογραφικό τύπο. Συνεργάστηκε επίσης με την Ελληνική Βιβλική Εταιρία και συμμετείχε ως λημματογράφος στη Μεγάλη Ορθόδοξη Χριστιανική Εγκυκλοπαίδεια (πρώτοι 6 τόμοι). Το πιο πρόσφατο έργο του αφορά τη χρήση της ζωικής ποικιλότητας στη Καινή διαθήκη και το περιβάλλον της και έχει το τίτλο: Φύσις Θηρίων. Η χρήση της Ζωικής Ποικιλότητας στην Καινή Διαθήκη και στο Περιβάλλον της, εκδόσεις Μέθεξις, Θεσσαλονίκη 2013. Ο κ. Γκουτζιούδης είχε την επιστημονική επιμέλεια του βιβλίου που κυκλοφόρησε στα ελληνικά πριν δύο μήνες: Colin J. Humphreys, Η ημέρα που σταυρώθηκε ο Ιησούς. Ανασυνθέτοντας τις τελευταίες ημέρες του πάθους, (μετάφραση Α. Κλήμη-επιστημονική επιμέλεια Μ. Γκουτζιούδης), εκδόσεις Μέθεξις, Θεσσαλονίκη 2015.
Αρκετές από τις δημοσιευμένες μελέτες του μπορεί κανείς να διαβάσει στον ιστοχώρο: Academia edu
Αρκετές από τις δημοσιευμένες μελέτες του μπορεί κανείς να διαβάσει στον ιστοχώρο: Academia edu